קיימות שתי צורות לניהול ספרי הנהלת חשבונות הנקבעות מתוקף הוראות ניהול ספרים -
1.הנהלת חשבונות חד-צידית – בשיטה זו רושמים רק את החשבוניות בגין ההכנסות וההוצאות ללא שום התייחסות ללקוחות, לספקים, לתזרימי המזומנים, חשבונות הבנקים וכדומה.
2.הנהלת חשבונות כפולה- בשיטה זו נותנים ביטוי לרישומי החשבוניות בגין ההכנסות וההוצאות לרבות התייחסות ללקוחות בעלי החוב ולספקים בעלי הזכות.